More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2300 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.26 
 
 		 457 aa  728    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.04 
 
 		 457 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.04 
 
 		 457 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  97.14 
 
 		 455 aa  817    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  83.04 
 
 		 457 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  97.14 
 
 		 455 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.04 
 
 		 457 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  83.04 
 
 		 457 aa  720    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.11 
 
 		 457 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.04 
 
 		 457 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  73.26 
 
 		 474 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  97.36 
 
 		 455 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  886    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  100 
 
 		 455 aa  886    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  97.36 
 
 		 455 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  94.93 
 
 		 455 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  74.05 
 
 		 485 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  71.59 
 
 		 480 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  61.78 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  59.51 
 
 		 455 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  60.18 
 
 		 457 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  59.78 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  60 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  60 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  59.78 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  60 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  60 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  59.56 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  60.4 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  59.73 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  57.73 
 
 		 445 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  55.76 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  53.33 
 
 		 464 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  56.98 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  56.01 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  57.08 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  54.78 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  56.32 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  56.09 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  55.96 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  56.01 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  54.97 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  55.45 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  56.61 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  56.61 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  54.46 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  51.8 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  55.1 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  51.82 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.24 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  53.08 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  52.86 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  51.72 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  52.25 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  53.25 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  55.06 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  54.82 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  51.87 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  47.11 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  45.54 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  45.54 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.1 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  47.13 
 
 		 481 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.06 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.5 
 
 		 462 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.68 
 
 		 500 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.11 
 
 		 482 aa  193  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 482 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.59 
 
 		 475 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 		 456 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 		 483 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.59 
 
 		 489 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.57 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 		 504 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 484 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>