More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2000 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  887    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  99.57 
 
 		 468 aa  881    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  69.57 
 
 		 474 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  67.11 
 
 		 476 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  69.09 
 
 		 463 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  52.83 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  53.64 
 
 		 474 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  52.86 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  52.86 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  52.19 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.64 
 
 		 457 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.97 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  52.41 
 
 		 457 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  52.85 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  52.63 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  53.65 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  53.23 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  52.76 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  53.88 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  52.65 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  50 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 475 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  48.37 
 
 		 464 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  44.8 
 
 		 488 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 455 aa  349  7e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.87 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.33 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  44.37 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  45.61 
 
 		 459 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  45.59 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  46.09 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 459 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  45.65 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  40.53 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  40.53 
 
 		 479 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 475 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 416 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  27.91 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.53 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.02 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.21 
 
 		 465 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.61 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 646 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 646 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 646 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.78 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.89 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  30.88 
 
 		 537 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>