More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3579 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
475 aa  947    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.05 
 
 
478 aa  567  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.49 
 
 
493 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.19 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.82 
 
 
482 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.82 
 
 
482 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  40.18 
 
 
458 aa  334  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 
474 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  40.69 
 
 
462 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 
477 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.1 
 
 
477 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.15 
 
 
461 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 
465 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 
483 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 
482 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.07 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
500 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 
496 aa  246  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  34.96 
 
 
492 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 
501 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
486 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 
495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  33.83 
 
 
487 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  32.94 
 
 
476 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  33.48 
 
 
470 aa  229  8e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
487 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
482 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.38 
 
 
465 aa  224  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 
520 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 
522 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 
515 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  31.7 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
474 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  32.14 
 
 
465 aa  220  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 
537 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 
472 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
491 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  30.6 
 
 
503 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  32.45 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  32.45 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  32.45 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  32.45 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  32.45 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  32.2 
 
 
457 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  32.2 
 
 
457 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  32.57 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  32.57 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  32.57 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.38 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 
522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  32.2 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 
515 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.5 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 
517 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 
514 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 
516 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 
504 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
579 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  29.15 
 
 
473 aa  210  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.42 
 
 
488 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.6 
 
 
461 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.09 
 
 
455 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  30.55 
 
 
457 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  32.86 
 
 
459 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  32.86 
 
 
442 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  29.78 
 
 
455 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  30.14 
 
 
472 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  29.78 
 
 
455 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  33.58 
 
 
458 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
502 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 
457 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 
505 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  32.59 
 
 
465 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  29.54 
 
 
455 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  29.64 
 
 
455 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  29.64 
 
 
455 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
455 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.12 
 
 
474 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  30.29 
 
 
457 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 
512 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  34.43 
 
 
466 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 
517 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.85 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  31.16 
 
 
464 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>