More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0323 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  100 
 
 
472 aa  922    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  52.33 
 
 
492 aa  498  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  54.55 
 
 
465 aa  478  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.31 
 
 
474 aa  475  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  54.32 
 
 
465 aa  474  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  53.38 
 
 
466 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  54.55 
 
 
465 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  52.57 
 
 
487 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  51.99 
 
 
467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  49.12 
 
 
456 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  48.79 
 
 
461 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  48.9 
 
 
456 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  48.9 
 
 
456 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 
462 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  47.46 
 
 
475 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  43.76 
 
 
462 aa  352  7e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  44.24 
 
 
458 aa  347  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  42.3 
 
 
467 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  40.36 
 
 
479 aa  341  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 
453 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
446 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  36.96 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 
466 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  36.81 
 
 
453 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 
474 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  37.41 
 
 
469 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  35.89 
 
 
467 aa  264  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 
471 aa  239  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 
474 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 
482 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 
475 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
478 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 
475 aa  213  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
487 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.19 
 
 
486 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  31.55 
 
 
477 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 
456 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
522 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.9 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.89 
 
 
478 aa  193  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 
469 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.9 
 
 
478 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
493 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 
477 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 
482 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 
482 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 
477 aa  186  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 
482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.44 
 
 
462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  33.26 
 
 
582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 
493 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.08 
 
 
501 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 
476 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 
504 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.19 
 
 
503 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 
493 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 
496 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 
477 aa  176  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  29.08 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.07 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0617  major facilitator transporter  33.41 
 
 
477 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 
576 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
495 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.93 
 
 
458 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  28.4 
 
 
473 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
581 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 
534 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.61 
 
 
469 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
570 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  32.27 
 
 
469 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 
483 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 
534 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.06 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
497 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 
512 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 
522 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.21 
 
 
505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.29 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  31.28 
 
 
589 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5625  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  28.4 
 
 
446 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  31.03 
 
 
498 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  31.04 
 
 
596 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  31.79 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  31.79 
 
 
531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  31.79 
 
 
531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 
478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>