More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1276 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  92.89 
 
 		 465 aa  860    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  92.89 
 
 		 465 aa  862    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  100 
 
 		 465 aa  916    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  51.84 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.99 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  50.55 
 
 		 467 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 456 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  45.51 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  47.92 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  50.44 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 475 aa  347  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 474 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  42.98 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 458 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.2 
 
 		 453 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  43.74 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 497 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  39.78 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  33.84 
 
 		 469 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 477 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 477 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 465 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 522 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.63 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 496 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.74 
 
 		 462 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.1 
 
 		 482 aa  186  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.81 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  31.8 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  28.22 
 
 		 526 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.33 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 509 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 495 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0607  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 582 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958846  normal  0.0536193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 460 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.31 
 
 		 510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.72 
 
 		 500 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  30.36 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 608 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0726  major facilitator superfamily transporter  32.21 
 
 		 576 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 		 493 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 581 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 		 504 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 504 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 502 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.81 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1280  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 562 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.09 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.08 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.08 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 504 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 504 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.4 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>