More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2729 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  100 
 
 		 469 aa  919    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 497 aa  326  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  41.5 
 
 		 467 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 456 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  37.05 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  40.27 
 
 		 466 aa  286  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  33.84 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  34.75 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  33.84 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 487 aa  256  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 462 aa  249  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.01 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 474 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  31.03 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 479 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 463 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.58 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.33 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.87 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 416 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.35 
 
 		 482 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.89 
 
 		 477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 456 aa  143  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  31.52 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.19 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.46 
 
 		 471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 573 aa  136  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 		 487 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  26.11 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 510 aa  133  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  26.14 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  27.65 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 589 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  28.17 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 484 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  26.99 
 
 		 473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 509 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 476 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3485  multidrug efflux protein  27.25 
 
 		 592 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.160972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  29.81 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 608 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>