More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2007 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
459 aa  905    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  41.74 
 
 
467 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
497 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 
466 aa  250  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  34.07 
 
 
465 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  33.04 
 
 
492 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  33.85 
 
 
465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  35.16 
 
 
469 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  33.63 
 
 
466 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  33.85 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  36.14 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  33.04 
 
 
465 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  30.75 
 
 
456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  31.13 
 
 
456 aa  226  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 
474 aa  226  9e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  31.19 
 
 
456 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  29.82 
 
 
463 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.39 
 
 
472 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  29.69 
 
 
487 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  29.05 
 
 
479 aa  209  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 
462 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  33.77 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  29.89 
 
 
453 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  30.54 
 
 
461 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
462 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
474 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  29.48 
 
 
467 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 
522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
446 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.76 
 
 
471 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 
483 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 
474 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.7 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  25.79 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 
500 aa  139  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 
475 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
478 aa  136  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.28 
 
 
478 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 
489 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  30.26 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 
529 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  26.52 
 
 
462 aa  126  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 
502 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 
485 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0999  major facilitator transporter  32.79 
 
 
430 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.77003  normal  0.0952773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 
456 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 
477 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  30.94 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 
496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.2 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 
534 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 
478 aa  120  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  27.85 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  27.85 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  29.31 
 
 
498 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  27.85 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  30.05 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  30.05 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  30.05 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.1 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.87 
 
 
510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  26.49 
 
 
508 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 
495 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.58 
 
 
471 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  28.83 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  29.04 
 
 
457 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.11 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 
534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.05 
 
 
465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  28.35 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  28.35 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  28.35 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  27.55 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 
493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.89 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  28.35 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  26.29 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  28.35 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  28.35 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  28.35 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  29.31 
 
 
518 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.05 
 
 
476 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.36 
 
 
461 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  24.55 
 
 
526 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.89 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  25.95 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>