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for query gene Cpin_3428 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 471 aa  942    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 521 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 		 529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 529 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 		 506 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 537 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.14 
 
 		 517 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 541 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 515 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 579 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 524 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 517 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 508 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.82 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 527 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
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NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 599 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 599 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.79 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
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NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  30.55 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  30.79 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.31 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.31 
 
 		 599 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 529 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
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NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 477 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 524 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 511 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 519 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 597 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 525 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.36 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.36 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  31.36 
 
 		 561 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 		 539 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 526 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.88 
 
 		 658 aa  192  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 520 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 539 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 528 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.07 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.05 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  29.34 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.33 
 
 		 528 aa  187  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 534 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 541 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 524 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.43 
 
 		 531 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.06 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.11 
 
 		 503 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 507 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 510 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 527 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  28.85 
 
 		 465 aa  183  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.16 
 
 		 514 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.67 
 
 		 538 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
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NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.76 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.81 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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