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for query gene Dfer_2019 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.9 
 
 
528 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  68.01 
 
 
529 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  74.9 
 
 
526 aa  830    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
524 aa  1058    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.64 
 
 
515 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.36 
 
 
525 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.51 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.86 
 
 
537 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.81 
 
 
513 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.47 
 
 
528 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.08 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.85 
 
 
519 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.03 
 
 
516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.02 
 
 
539 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.8 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 
521 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.16 
 
 
537 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 
515 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 
517 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 
532 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 
515 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.76 
 
 
517 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 
520 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 
530 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 
529 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 
529 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 
529 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.96 
 
 
506 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
526 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.13 
 
 
511 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 
525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 
517 aa  319  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.19 
 
 
529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 
511 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  33.07 
 
 
561 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 
519 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.07 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
539 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.07 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.07 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  33.07 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 
530 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
534 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
530 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 
534 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
530 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
530 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 
529 aa  297  3e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 
508 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  32.21 
 
 
495 aa  295  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  33.79 
 
 
512 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2483  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 
504 aa  293  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.35671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.6 
 
 
524 aa  293  6e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 
512 aa  293  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.83 
 
 
512 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  33.85 
 
 
512 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  33.85 
 
 
512 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  33.85 
 
 
512 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 
515 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 
520 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33 
 
 
520 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 
532 aa  290  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
532 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 
535 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
511 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.88 
 
 
503 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 
510 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.21 
 
 
509 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  33.78 
 
 
512 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.77 
 
 
522 aa  286  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  31.45 
 
 
534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 
537 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 
520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 
520 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  35.21 
 
 
501 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 
519 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  33.4 
 
 
512 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
511 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.47 
 
 
524 aa  283  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 
511 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 
544 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
520 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 
511 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 
510 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  31.84 
 
 
496 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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