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for query gene Ppha_0063 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  82.53 
 
 
528 aa  865    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.95 
 
 
523 aa  859    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.31 
 
 
539 aa  825    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.05 
 
 
537 aa  840    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
539 aa  1081    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.44 
 
 
516 aa  500  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.35 
 
 
515 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.59 
 
 
526 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.58 
 
 
513 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.06 
 
 
525 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.51 
 
 
524 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.95 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.54 
 
 
537 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.12 
 
 
529 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.72 
 
 
519 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 
529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.92 
 
 
529 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 
532 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.4 
 
 
515 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 
520 aa  349  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 
517 aa  349  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.59 
 
 
529 aa  349  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
521 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 
537 aa  346  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 
506 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 
517 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.7 
 
 
539 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.7 
 
 
539 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.7 
 
 
539 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 
530 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.31 
 
 
539 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.31 
 
 
539 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.31 
 
 
539 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.31 
 
 
539 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 
530 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.67 
 
 
529 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.21 
 
 
530 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 
530 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.72 
 
 
530 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.9 
 
 
534 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 
519 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  34.17 
 
 
561 aa  297  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 
511 aa  294  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.06 
 
 
520 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.46 
 
 
520 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  33.46 
 
 
518 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 
536 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 
508 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 
524 aa  286  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 
511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 
521 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
518 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.74 
 
 
517 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 
527 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
518 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 
531 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 
520 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.21 
 
 
529 aa  279  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
522 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.41 
 
 
520 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 
520 aa  276  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 
526 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
520 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
525 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
520 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 
516 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  34.78 
 
 
512 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
511 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
520 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 
520 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.76 
 
 
511 aa  273  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.28 
 
 
494 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
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NC_011989  Avi_3836  MFS permease  30.41 
 
 
525 aa  272  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 
533 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.16 
 
 
514 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.93 
 
 
514 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
520 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 
513 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 
520 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 
520 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 
520 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
554 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 
520 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 
525 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.420872 
 
 
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NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 
525 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  34.44 
 
 
511 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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