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for query gene Sfum_3317 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 526 aa  1059    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.58 
 
 		 506 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.87 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.17 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.37 
 
 		 520 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.48 
 
 		 537 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.58 
 
 		 521 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.66 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.78 
 
 		 517 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.81 
 
 		 519 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.58 
 
 		 511 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.61 
 
 		 532 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.53 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.61 
 
 		 526 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.73 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.19 
 
 		 532 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 		 530 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.11 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.11 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 		 539 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.11 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.11 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.61 
 
 		 534 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.24 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.61 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 522 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  40.08 
 
 		 561 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.8 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 511 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.52 
 
 		 526 aa  364  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.31 
 
 		 511 aa  362  6e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  39.67 
 
 		 518 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.3 
 
 		 511 aa  361  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.75 
 
 		 520 aa  359  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.09 
 
 		 522 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 		 508 aa  356  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.04 
 
 		 520 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.47 
 
 		 518 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.29 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.49 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.5 
 
 		 510 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.5 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.51 
 
 		 514 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 537 aa  351  1e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.41 
 
 		 527 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.4 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.01 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.01 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.69 
 
 		 520 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.3 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  39.3 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  39.3 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.47 
 
 		 516 aa  349  6e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.55 
 
 		 531 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 520 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.52 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.41 
 
 		 520 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 554 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.43 
 
 		 544 aa  346  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  39.17 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 		 519 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 520 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.03 
 
 		 539 aa  342  7e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 		 519 aa  343  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 520 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.87 
 
 		 520 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 509 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 512 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 		 539 aa  341  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.87 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  37.14 
 
 		 512 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.07 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.91 
 
 		 519 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 		 512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  37.35 
 
 		 512 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
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