More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1908 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  97.6 
 
 		 512 aa  958    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.94 
 
 		 511 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.29 
 
 		 512 aa  965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 509 aa  1011    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  84.97 
 
 		 512 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  83.76 
 
 		 534 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.7 
 
 		 532 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.52 
 
 		 508 aa  908    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.96 
 
 		 493 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  60.72 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.72 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  59.63 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.25 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.18 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  55.25 
 
 		 507 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.98 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.2 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.75 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.56 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.4 
 
 		 527 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.21 
 
 		 527 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.42 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54 
 
 		 526 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.78 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.5 
 
 		 513 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.12 
 
 		 520 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 		 518 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.61 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 		 512 aa  475  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.08 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.11 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.21 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.17 
 
 		 517 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.97 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.44 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.56 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  42.44 
 
 		 561 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 537 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.34 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.06 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.35 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.65 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.07 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  40.48 
 
 		 503 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.48 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 532 aa  355  6.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.2 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.4 
 
 		 526 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.21 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  37.55 
 
 		 526 aa  333  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.25 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.25 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.92 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  35.45 
 
 		 495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  36.05 
 
 		 496 aa  320  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 532 aa  318  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.15 
 
 		 529 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 534 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.9 
 
 		 534 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.22 
 
 		 530 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 		 525 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  36.12 
 
 		 539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 539 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.11 
 
 		 518 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.54 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.29 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.77 
 
 		 511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.29 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  35.29 
 
 		 539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.96 
 
 		 522 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 520 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 519 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.58 
 
 		 510 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  36.38 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 		 520 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  36.38 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 529 aa  299  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  38.58 
 
 		 512 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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