More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0039 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.46 
 
 
523 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.34 
 
 
539 aa  818    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
537 aa  1073    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  79.05 
 
 
539 aa  840    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  80.81 
 
 
528 aa  849    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.91 
 
 
516 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.72 
 
 
515 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.85 
 
 
526 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.56 
 
 
528 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.78 
 
 
513 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.78 
 
 
529 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.75 
 
 
525 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.86 
 
 
524 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.14 
 
 
537 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.53 
 
 
519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.2 
 
 
529 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 
529 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
520 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.13 
 
 
515 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.12 
 
 
521 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 
515 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 
532 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.03 
 
 
506 aa  360  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.11 
 
 
517 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 
529 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.93 
 
 
537 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.3 
 
 
517 aa  349  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 
530 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 
534 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.55 
 
 
526 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 
534 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.63 
 
 
530 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.72 
 
 
511 aa  330  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
539 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
539 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.87 
 
 
539 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 
530 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 
530 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.21 
 
 
530 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.32 
 
 
519 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.16 
 
 
529 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.87 
 
 
539 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
539 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.87 
 
 
539 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  34.87 
 
 
539 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  34.76 
 
 
561 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
517 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 
532 aa  286  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 
520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.95 
 
 
520 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 
511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 
524 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  32.61 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 
526 aa  280  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 
527 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 
522 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 
527 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
508 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 
536 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 
513 aa  277  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.04 
 
 
531 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 
527 aa  276  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
554 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 
513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
529 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 
525 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 
512 aa  273  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 
520 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.07 
 
 
513 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  31.03 
 
 
525 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.36 
 
 
514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  29.63 
 
 
534 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 
522 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.16 
 
 
518 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 
518 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
520 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 
514 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
520 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
520 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
520 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 
532 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 
520 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  30.89 
 
 
495 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.8 
 
 
529 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.37 
 
 
529 aa  266  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 
519 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 
519 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 
520 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 
519 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  33.47 
 
 
519 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 
520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
520 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.59 
 
 
520 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>