More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6155 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.62 
 
 		 539 aa  896    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.19 
 
 		 539 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  84.19 
 
 		 539 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 530 aa  1065    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  89.62 
 
 		 530 aa  966    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.62 
 
 		 539 aa  896    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.32 
 
 		 534 aa  994    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  80.5 
 
 		 529 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.43 
 
 		 530 aa  1060    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  99.43 
 
 		 530 aa  1060    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.62 
 
 		 539 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.62 
 
 		 539 aa  896    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  84.19 
 
 		 539 aa  902    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  93.38 
 
 		 534 aa  997    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  60.27 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.81 
 
 		 532 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.65 
 
 		 525 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.07 
 
 		 522 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 		 530 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.41 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.73 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.66 
 
 		 536 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.94 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.29 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.49 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.11 
 
 		 521 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 526 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 		 506 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 		 537 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  39.53 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 		 517 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.57 
 
 		 539 aa  347  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 520 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.69 
 
 		 517 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.52 
 
 		 520 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.11 
 
 		 520 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.76 
 
 		 516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.59 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 520 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 520 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 520 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.94 
 
 		 537 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.52 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.76 
 
 		 520 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.56 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 539 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.01 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  36.53 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  36.53 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 523 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 511 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 		 528 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  35.42 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.7 
 
 		 532 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 511 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.89 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.89 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 513 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  36.89 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 524 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  35.21 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2736  multidrug resistance protein Y  36.67 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.416223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  35.21 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  35.21 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.62 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.74 
 
 		 512 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 513 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3598  multidrug resistance protein Y  36.67 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0257273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02277  predicted multidrug efflux system  36.67 
 
 		 512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.866508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  35.24 
 
 		 509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02238  hypothetical protein  36.67 
 
 		 512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.945599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2504  multidrug resistance protein Y  36.67 
 
 		 512 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0957152  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 527 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.13 
 
 		 520 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>