More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2434 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.23 
 
 		 522 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.24 
 
 		 532 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 525 aa  1053    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.7 
 
 		 526 aa  793    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  57.31 
 
 		 529 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.79 
 
 		 534 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.58 
 
 		 534 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.19 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.73 
 
 		 530 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  55.19 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.19 
 
 		 539 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.81 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  54.81 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  54.81 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  54.81 
 
 		 539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.74 
 
 		 530 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.94 
 
 		 530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.94 
 
 		 530 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.33 
 
 		 530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.85 
 
 		 515 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.74 
 
 		 520 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.35 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.62 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.44 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.15 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.92 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.6 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.84 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 517 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.76 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 519 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.51 
 
 		 554 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.92 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 516 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  38.21 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  36.24 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  36.24 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.24 
 
 		 511 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.49 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.08 
 
 		 515 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 524 aa  333  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  37.75 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.01 
 
 		 511 aa  331  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  37.27 
 
 		 512 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  37.27 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  37.27 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  37.27 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 		 526 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 524 aa  327  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.77 
 
 		 527 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.75 
 
 		 513 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.87 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.57 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  37.27 
 
 		 512 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 508 aa  320  6e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  37.52 
 
 		 515 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.08 
 
 		 512 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.86 
 
 		 520 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 520 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 520 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 520 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 520 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 		 513 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.77 
 
 		 527 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.36 
 
 		 520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.21 
 
 		 511 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 520 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.88 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.95 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 513 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.32 
 
 		 534 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 520 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 520 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.25 
 
 		 512 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 520 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 		 511 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  33.6 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.83 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  40.29 
 
 		 509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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