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for query gene BRA0116 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 529 aa  1063    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.34 
 
 		 529 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  63.95 
 
 		 525 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  88.99 
 
 		 525 aa  953    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  68.27 
 
 		 532 aa  733    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  68.28 
 
 		 525 aa  733    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  99.62 
 
 		 529 aa  1060    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.91 
 
 		 525 aa  681    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.62 
 
 		 525 aa  674    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.28 
 
 		 528 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.93 
 
 		 529 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  68.65 
 
 		 532 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.47 
 
 		 532 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.62 
 
 		 525 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.5 
 
 		 522 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  58.38 
 
 		 530 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.96 
 
 		 528 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.28 
 
 		 531 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.87 
 
 		 528 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  57.87 
 
 		 529 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.91 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.94 
 
 		 516 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.06 
 
 		 526 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.84 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.58 
 
 		 536 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.69 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  47.54 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.02 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.09 
 
 		 543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.45 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.28 
 
 		 523 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.89 
 
 		 532 aa  428  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.22 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.5 
 
 		 524 aa  425  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.5 
 
 		 524 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.11 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.31 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.11 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.61 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 511 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.05 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 		 512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 510 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.37 
 
 		 539 aa  339  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1870  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.78 
 
 		 532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  38.6 
 
 		 529 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  41.63 
 
 		 532 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 		 543 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 539 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 516 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.43 
 
 		 536 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.03 
 
 		 540 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  36.27 
 
 		 499 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  35.48 
 
 		 519 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  40.09 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 526 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 		 542 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 535 aa  319  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 538 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 542 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.64 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 542 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  34.73 
 
 		 528 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 		 535 aa  312  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.35 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.12 
 
 		 539 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.15 
 
 		 535 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 532 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 526 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  33.59 
 
 		 534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  35.48 
 
 		 524 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 527 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.82 
 
 		 516 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 		 517 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 535 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.98 
 
 		 521 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 537 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.43 
 
 		 532 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 527 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 		 537 aa  276  5e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 523 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 515 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.78 
 
 		 527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 530 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.47 
 
 		 529 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 529 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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