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for query gene Sama_0403 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  73.79 
 
 		 542 aa  756    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  73.33 
 
 		 539 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.79 
 
 		 542 aa  758    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.6 
 
 		 526 aa  754    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.78 
 
 		 526 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.36 
 
 		 538 aa  747    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.18 
 
 		 535 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.79 
 
 		 542 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  100 
 
 		 529 aa  1062    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.36 
 
 		 535 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.56 
 
 		 535 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.21 
 
 		 543 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.79 
 
 		 542 aa  757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  54.99 
 
 		 534 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.12 
 
 		 517 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.14 
 
 		 516 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.75 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.94 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  52.61 
 
 		 519 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.66 
 
 		 516 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  52.07 
 
 		 499 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.25 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.56 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.61 
 
 		 540 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.83 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 		 523 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.49 
 
 		 536 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.7 
 
 		 539 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.83 
 
 		 529 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.16 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 527 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 527 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.77 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.13 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2067  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.87 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.7 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3676  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.87 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.6 
 
 		 536 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.1 
 
 		 526 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.55 
 
 		 523 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.56 
 
 		 516 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.75 
 
 		 523 aa  350  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  39.2 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 		 524 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.55 
 
 		 524 aa  346  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.93 
 
 		 524 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.71 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.73 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.57 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 524 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.83 
 
 		 524 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  35.63 
 
 		 524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 525 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.84 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.13 
 
 		 529 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  38.09 
 
 		 525 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.33 
 
 		 529 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  37.22 
 
 		 528 aa  332  8e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 528 aa  332  9e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 		 525 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.15 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.12 
 
 		 522 aa  323  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.82 
 
 		 530 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.49 
 
 		 528 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 523 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.48 
 
 		 530 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 532 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48300  putative MFS transporter  40.46 
 
 		 503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.966541  normal  0.132172 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 529 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
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NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.4 
 
 		 543 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 528 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.85 
 
 		 516 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  35.82 
 
 		 529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
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NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 		 516 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 529 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 		 515 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.13 
 
 		 517 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 515 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.92 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.14 
 
 		 520 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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