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for query gene BamMC406_6273 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.27 
 
 		 539 aa  905    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.08 
 
 		 539 aa  901    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.75 
 
 		 530 aa  980    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  83.27 
 
 		 539 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.08 
 
 		 539 aa  901    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.08 
 
 		 539 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  91.2 
 
 		 530 aa  987    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  80.57 
 
 		 529 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 534 aa  1074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.56 
 
 		 530 aa  978    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.75 
 
 		 530 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.27 
 
 		 539 aa  905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  98.88 
 
 		 534 aa  1063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  83.08 
 
 		 539 aa  901    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.08 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.2 
 
 		 532 aa  595  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.79 
 
 		 525 aa  585  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.54 
 
 		 522 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.53 
 
 		 530 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.1 
 
 		 532 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.47 
 
 		 536 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.34 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.96 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.08 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.1 
 
 		 515 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.61 
 
 		 526 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.5 
 
 		 506 aa  359  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.04 
 
 		 521 aa  359  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.3 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  40.31 
 
 		 525 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 		 537 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.7 
 
 		 517 aa  350  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 539 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.13 
 
 		 517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.21 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 520 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.52 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.15 
 
 		 513 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 520 aa  330  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 520 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 520 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 520 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 520 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.85 
 
 		 528 aa  324  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.71 
 
 		 520 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.83 
 
 		 511 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.85 
 
 		 513 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.33 
 
 		 511 aa  322  8e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.32 
 
 		 520 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 539 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 527 aa  319  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 526 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  35.91 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  35.91 
 
 		 511 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 527 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  34.79 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  34.38 
 
 		 512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 515 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 513 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.91 
 
 		 511 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 518 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  35.63 
 
 		 509 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.14 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.83 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  34.17 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
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NC_010468  EcolC_1302  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  34.17 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2653  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.14 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2517  multidrug resistance protein Y  36.14 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.84 
 
 		 511 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  34.17 
 
 		 512 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 		 512 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
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