More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5006 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.99 
 
 		 516 aa  668    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 513 aa  1022    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.42 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.01 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.82 
 
 		 537 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.81 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.72 
 
 		 539 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.4 
 
 		 537 aa  485  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.22 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.22 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.27 
 
 		 526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.5 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.33 
 
 		 524 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.53 
 
 		 529 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.42 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.04 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 		 521 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 529 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 515 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.78 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.99 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.95 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  34.95 
 
 		 561 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 		 532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 517 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 		 526 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.46 
 
 		 517 aa  312  9e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.71 
 
 		 508 aa  302  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.64 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 527 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 527 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
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NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 514 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 526 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.36 
 
 		 511 aa  293  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.05 
 
 		 538 aa  292  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 		 520 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.39 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 		 543 aa  289  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.53 
 
 		 529 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  32.54 
 
 		 518 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.26 
 
 		 514 aa  286  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 		 525 aa  286  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 		 513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 		 526 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
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NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 532 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 526 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 535 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 		 520 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.11 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 535 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 530 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 		 516 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.86 
 
 		 514 aa  280  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 543 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.99 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 		 535 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 520 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 542 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 542 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 542 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  32.73 
 
 		 539 aa  276  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 		 526 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 519 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  32.19 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 520 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 519 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  32.67 
 
 		 512 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  32.67 
 
 		 512 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 520 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  32.46 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.53 
 
 		 540 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.99 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.99 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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