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for query gene Cpin_5331 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 525 aa  1065    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.27 
 
 		 537 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.61 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.94 
 
 		 526 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.37 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.75 
 
 		 524 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.06 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.75 
 
 		 528 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.75 
 
 		 537 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.96 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.98 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.12 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.58 
 
 		 528 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.76 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.66 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.38 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 537 aa  360  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.43 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.27 
 
 		 517 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 529 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.45 
 
 		 517 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.65 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35 
 
 		 529 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.59 
 
 		 530 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.09 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 529 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.85 
 
 		 511 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.29 
 
 		 526 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.07 
 
 		 529 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  34.06 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.87 
 
 		 524 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 519 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 		 519 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  33.33 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 518 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 519 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.74 
 
 		 519 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.14 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.77 
 
 		 509 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.33 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 527 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.67 
 
 		 519 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.53 
 
 		 521 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  32.8 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  35.81 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.81 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  35.81 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 539 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  32.6 
 
 		 539 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 530 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 		 522 aa  282  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  32.6 
 
 		 539 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  32.6 
 
 		 539 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.21 
 
 		 511 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 544 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  35.48 
 
 		 512 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 517 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.72 
 
 		 512 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.02 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.87 
 
 		 520 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  35.25 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  35.25 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  35.25 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.25 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 522 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 536 aa  276  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 510 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.54 
 
 		 520 aa  276  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 534 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 		 511 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.45 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.46 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
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NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.63 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.99 
 
 		 525 aa  272  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.52 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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