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for query gene Franean1_6823 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 558 aa  1058    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.24 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.98 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.97 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  42.02 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.97 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  42.02 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  42.13 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  45.3 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.67 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.46 
 
 		 480 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  41.51 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  43.13 
 
 		 480 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.69 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.53 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_013131  Caci_2750  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.5 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.51 
 
 		 504 aa  249  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 541 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 		 501 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 534 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 		 514 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.03 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.34 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.36 
 
 		 511 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.01 
 
 		 510 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  37.08 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.71 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.3 
 
 		 517 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  33.88 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  33.8 
 
 		 561 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  33.88 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.88 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.52 
 
 		 503 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 		 510 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  34.25 
 
 		 512 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  34.25 
 
 		 512 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  34.25 
 
 		 512 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
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NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  34.25 
 
 		 512 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
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NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.06 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 513 aa  210  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.42 
 
 		 496 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 646 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 515 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.01 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 646 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.64 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 520 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 520 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 520 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
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NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 520 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 520 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 520 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 510 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  33.58 
 
 		 512 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.16 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.01 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.76 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  31.95 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  31.95 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 549 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  32.78 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  31.95 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.63 
 
 		 529 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.1 
 
 		 483 aa  204  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.33 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  31.73 
 
 		 475 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 		 529 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.94 
 
 		 488 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
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NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 531 aa  203  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 478 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 478 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 		 565 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.02 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
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