More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2014 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 523 aa  1012    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  73.95 
 
 		 558 aa  708    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.7 
 
 		 519 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.69 
 
 		 559 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.09 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.75 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.26 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.81 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.01 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.33 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.89 
 
 		 531 aa  361  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.47 
 
 		 488 aa  359  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  46.61 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.31 
 
 		 534 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.09 
 
 		 504 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.33 
 
 		 491 aa  339  8e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 		 517 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.11 
 
 		 493 aa  336  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  51.44 
 
 		 536 aa  326  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.8 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.34 
 
 		 536 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.29 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.4 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.86 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.57 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.3 
 
 		 480 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.24 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  38.83 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.65 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.57 
 
 		 461 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.8 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.08 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.52 
 
 		 578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.45 
 
 		 484 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  35.87 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  33.02 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.15 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.89 
 
 		 514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 		 480 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 579 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.15 
 
 		 515 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  32.78 
 
 		 436 aa  241  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  33.5 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.5 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  33.1 
 
 		 561 aa  238  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.5 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.47 
 
 		 476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.17 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.33 
 
 		 480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 511 aa  233  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.05 
 
 		 514 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 		 529 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  33.01 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.95 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.49 
 
 		 476 aa  231  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 520 aa  229  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 		 558 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 529 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.79 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.79 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.26 
 
 		 635 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 658 aa  221  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 543 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 545 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.6 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.81 
 
 		 521 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 		 537 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.83 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.83 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  29.7 
 
 		 496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  31.33 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.57 
 
 		 599 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 599 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.33 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.03 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.33 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 599 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.33 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.33 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 678 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 508 aa  210  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 475 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 532 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 525 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 506 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 554 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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