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for query gene Gdia_2404 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 465 aa  881    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  61.05 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.29 
 
 		 485 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.94 
 
 		 485 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.5 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.58 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.58 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  65.58 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.47 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55.6 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.46 
 
 		 523 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.09 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.91 
 
 		 558 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 479 aa  259  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.48 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.85 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.13 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 		 485 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.68 
 
 		 473 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 559 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 		 517 aa  216  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.55 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.76 
 
 		 519 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.82 
 
 		 536 aa  213  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.43 
 
 		 504 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.39 
 
 		 488 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.27 
 
 		 534 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.96 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.1 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  33.95 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  28.64 
 
 		 436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  29.97 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.11 
 
 		 515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.91 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.88 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 578 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.67 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 534 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  27.34 
 
 		 493 aa  169  9e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.59 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 558 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.94 
 
 		 536 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.6 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.72 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.2 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.23 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 		 520 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  34.78 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  34.78 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  34.78 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  34.78 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 		 520 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  34.47 
 
 		 475 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 520 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  34.47 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.99 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  34.47 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  33.54 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  33.54 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.79 
 
 		 503 aa  158  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  33.54 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  33.54 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 520 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 520 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  33.33 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 607 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.62 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
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NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
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NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.71 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 516 aa  154  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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