More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1244 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
559 aa  1070    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.62 
 
 
558 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.69 
 
 
523 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.44 
 
 
479 aa  432  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.69 
 
 
541 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.89 
 
 
510 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.58 
 
 
491 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.96 
 
 
519 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.02 
 
 
509 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.1 
 
 
485 aa  365  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.53 
 
 
483 aa  349  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.37 
 
 
488 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.01 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 
534 aa  335  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.17 
 
 
467 aa  334  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.92 
 
 
531 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.98 
 
 
473 aa  324  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.6 
 
 
504 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 
517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.92 
 
 
467 aa  320  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.89 
 
 
445 aa  314  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.88 
 
 
493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 
473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  46.65 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  38.03 
 
 
455 aa  303  7.000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.95 
 
 
536 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.3 
 
 
463 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  40.52 
 
 
540 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.43 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 
578 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.54 
 
 
461 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 
485 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.75 
 
 
485 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  33.96 
 
 
493 aa  250  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.73 
 
 
484 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
475 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
475 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.97 
 
 
475 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  33.97 
 
 
436 aa  243  6e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
515 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.56 
 
 
534 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 
521 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 
537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.27 
 
 
515 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 
579 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 
529 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.78 
 
 
529 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.34 
 
 
635 aa  229  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 
484 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.26 
 
 
529 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 
460 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.15 
 
 
515 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 
570 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 
517 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.41 
 
 
545 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 
510 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.86 
 
 
503 aa  220  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.84 
 
 
526 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.61 
 
 
480 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 
536 aa  216  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  33.91 
 
 
561 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
554 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 
480 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 
480 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  32.21 
 
 
480 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.28 
 
 
666 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.21 
 
 
480 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.44 
 
 
514 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 
517 aa  210  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  32.21 
 
 
480 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 
496 aa  210  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.18 
 
 
680 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.69 
 
 
480 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.37 
 
 
476 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 
506 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 
517 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 
561 aa  209  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.45 
 
 
476 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  31.95 
 
 
496 aa  209  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 
465 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.21 
 
 
480 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
511 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  29.96 
 
 
492 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.87 
 
 
492 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 
508 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.45 
 
 
513 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 
543 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.49 
 
 
564 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.44 
 
 
532 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  29.66 
 
 
492 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.74 
 
 
492 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.51 
 
 
513 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 
492 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 
492 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 
492 aa  204  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 
522 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
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