More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4465 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.39 
 
 		 484 aa  762    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 485 aa  944    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.92 
 
 		 475 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.92 
 
 		 475 aa  746    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  85.23 
 
 		 484 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  97.94 
 
 		 485 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  87.92 
 
 		 475 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  69.18 
 
 		 480 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  64.99 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.94 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 460 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.09 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 479 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.75 
 
 		 519 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.57 
 
 		 510 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.95 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.41 
 
 		 559 aa  243  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.36 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.76 
 
 		 483 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 467 aa  236  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.72 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.11 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.94 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 		 491 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.29 
 
 		 536 aa  222  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.18 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 		 531 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.28 
 
 		 534 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  32.48 
 
 		 540 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 493 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.1 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  28.7 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  28.83 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  27.92 
 
 		 436 aa  189  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 514 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 578 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 579 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 532 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 514 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.81 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  30.56 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.56 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.44 
 
 		 558 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 507 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 529 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.95 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.06 
 
 		 503 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.1 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  29.11 
 
 		 475 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 		 519 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 480 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.03 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.42 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.53 
 
 		 517 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
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