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for query gene Bxe_C0760 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  100 
 
 		 461 aa  891    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.99 
 
 		 485 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.91 
 
 		 484 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.77 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  61.23 
 
 		 480 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.89 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.89 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  63.89 
 
 		 475 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.47 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.93 
 
 		 465 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 479 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.45 
 
 		 558 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 		 541 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.89 
 
 		 510 aa  249  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.56 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.72 
 
 		 488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.75 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.89 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.9 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 		 559 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.63 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 509 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 473 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.91 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 531 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.29 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 534 aa  210  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.62 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  33.65 
 
 		 540 aa  202  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  30.24 
 
 		 480 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.24 
 
 		 480 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.24 
 
 		 480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 		 515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  29.01 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  29.79 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.65 
 
 		 536 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 537 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 		 521 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  28.97 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.58 
 
 		 476 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 532 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.64 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.03 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.58 
 
 		 476 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.76 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.28 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.19 
 
 		 558 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.75 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 		 578 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 514 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  29.98 
 
 		 475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  29.49 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  31.07 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  31.07 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  31.07 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.15 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.98 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 		 526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  30.84 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  29.64 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  29.64 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.64 
 
 		 475 aa  163  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 		 475 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 515 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.41 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  29.41 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 		 579 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  29.64 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.64 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.35 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  28.29 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  33.85 
 
 		 466 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.37 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.7 
 
 		 507 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
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NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  32.48 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.95 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
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