More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2825 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
473 aa  929    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  43.3 
 
 
493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  48.84 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.55 
 
 
479 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  42.82 
 
 
455 aa  345  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.44 
 
 
558 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.19 
 
 
510 aa  294  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.6 
 
 
523 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.07 
 
 
488 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.79 
 
 
559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.52 
 
 
541 aa  274  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 
491 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 
483 aa  270  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 
467 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.96 
 
 
501 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.77 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.57 
 
 
467 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.4 
 
 
445 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 
504 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.12 
 
 
536 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.04 
 
 
473 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.07 
 
 
485 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 
517 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.12 
 
 
534 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 
531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 
536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.68 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
485 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.58 
 
 
461 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.38 
 
 
484 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
520 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 
463 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 
493 aa  203  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  29.31 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
521 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  29.63 
 
 
561 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 
537 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
460 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.38 
 
 
511 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 
484 aa  193  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 
510 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.79 
 
 
503 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 
475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 
475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 
475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 
515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 
515 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 
534 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 
517 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 
515 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 
471 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  29.66 
 
 
465 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 
475 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 
527 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 
558 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 
526 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 
508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 
526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.08 
 
 
527 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.02 
 
 
514 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 
524 aa  180  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.68 
 
 
579 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 
479 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.68 
 
 
479 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 
514 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
465 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 
526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 
515 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
507 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.13 
 
 
507 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 
507 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 
530 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
579 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  27.25 
 
 
480 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 
529 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.92 
 
 
513 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 
561 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  27.78 
 
 
534 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 
521 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 
490 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.01 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.01 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.44 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  27.01 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.01 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 
480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 
529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.970656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>