More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0874 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 479 aa  928    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.09 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  47.85 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.44 
 
 		 559 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.75 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.55 
 
 		 473 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.38 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.03 
 
 		 510 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  46.71 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.31 
 
 		 541 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.4 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.91 
 
 		 509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  41.53 
 
 		 493 aa  339  7e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.63 
 
 		 519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.22 
 
 		 467 aa  332  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  43.52 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.32 
 
 		 485 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.66 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.02 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.3 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.57 
 
 		 534 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.88 
 
 		 463 aa  289  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.78 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.38 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.84 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.08 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  36.58 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.08 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.92 
 
 		 485 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 		 578 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.71 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.14 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 480 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 534 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.38 
 
 		 529 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 521 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.09 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.65 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  30.22 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.22 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.7 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.87 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.68 
 
 		 480 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.65 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 511 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  31.54 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  31.54 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  28.68 
 
 		 490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.11 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  29.55 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.3 
 
 		 514 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 545 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  29.55 
 
 		 512 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  29.32 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.16 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  29.32 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.54 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 521 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 513 aa  193  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 		 510 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.21 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.16 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 		 475 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.67 
 
 		 520 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 570 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 521 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.43 
 
 		 515 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 517 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 520 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
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NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.8 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.13 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 507 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
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NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  28.78 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
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