More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2404 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
480 aa  955    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  94.38 
 
 
480 aa  911    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  94.38 
 
 
480 aa  911    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  93.96 
 
 
480 aa  888    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  72.59 
 
 
466 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  95.83 
 
 
480 aa  890    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.08 
 
 
480 aa  869    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  94.38 
 
 
480 aa  911    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  94.38 
 
 
480 aa  911    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  90.83 
 
 
476 aa  852    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  91.25 
 
 
476 aa  854    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.2 
 
 
475 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.54 
 
 
558 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
514 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 
515 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2750  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 
501 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.06 
 
 
523 aa  240  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
510 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.7 
 
 
545 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
501 aa  229  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 
519 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 
534 aa  226  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.78 
 
 
509 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 
532 aa  224  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 
504 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.3 
 
 
479 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.03 
 
 
514 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 
467 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
520 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 
531 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
524 aa  209  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.64 
 
 
488 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 
579 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 
483 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 
521 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
478 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 
478 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 
537 aa  207  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 
549 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 
478 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 
526 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 
538 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 
478 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
529 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.74 
 
 
494 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 
522 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 
537 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.45 
 
 
515 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 
534 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 
635 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.66 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.37 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  28.48 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.71 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  28.54 
 
 
475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 
541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  29.25 
 
 
540 aa  200  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  29.38 
 
 
474 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 
490 aa  200  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  28.73 
 
 
475 aa  199  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  29.17 
 
 
498 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  28.54 
 
 
475 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  28.92 
 
 
484 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  28.54 
 
 
475 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  28.54 
 
 
475 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 
485 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 
561 aa  199  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  31.96 
 
 
482 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 
517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 
529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.31 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  28.7 
 
 
475 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  28.48 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  28.48 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.48 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.83 
 
 
528 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.26 
 
 
475 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.48 
 
 
467 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.33 
 
 
529 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  31.74 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  31.74 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  31.74 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  28.98 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0901797 
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
578 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  31.74 
 
 
476 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
490 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.57 
 
 
529 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  31.74 
 
 
537 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  29.15 
 
 
471 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  30.92 
 
 
554 aa  197  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  29.15 
 
 
471 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 
490 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 
490 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
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NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
495 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.61 
 
 
511 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
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NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
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