More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2724 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.23 
 
 
514 aa  924    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
515 aa  1008    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.72 
 
 
558 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.37 
 
 
480 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 
480 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.56 
 
 
476 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.6 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.53 
 
 
480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  40.34 
 
 
480 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 
480 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  37.96 
 
 
480 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 
480 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.96 
 
 
480 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.81 
 
 
466 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.18 
 
 
475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 
579 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 
545 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.86 
 
 
523 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 
514 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 
510 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.01 
 
 
534 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.98 
 
 
524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 
501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 
501 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 
541 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  32.42 
 
 
489 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.49 
 
 
475 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 
558 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
494 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.2 
 
 
504 aa  226  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 
549 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 
478 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 
478 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  32.67 
 
 
475 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  31.66 
 
 
475 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  32.67 
 
 
475 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  32.67 
 
 
475 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  32.67 
 
 
475 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 
473 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  30.82 
 
 
482 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  31.71 
 
 
475 aa  223  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.19 
 
 
471 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  32.02 
 
 
471 aa  223  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.68 
 
 
490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  31.16 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.02 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  31.43 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  31.22 
 
 
475 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  31.81 
 
 
467 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.75 
 
 
478 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 
489 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.75 
 
 
483 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
478 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  34.71 
 
 
491 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  34.29 
 
 
504 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 
520 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 
517 aa  216  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.16 
 
 
478 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 
508 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  36.19 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  34.66 
 
 
495 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 
528 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  32.31 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  34.76 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  31.03 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  31.59 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  33.4 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 
469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 
480 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 
495 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 
534 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2259  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.39 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1095  MFS transporter  32.39 
 
 
463 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0945  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.39 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0556  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.39 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0941  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  32.39 
 
 
479 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  30.82 
 
 
470 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.83 
 
 
763 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  37.35 
 
 
469 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  30.82 
 
 
470 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 
478 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  30.82 
 
 
470 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 
502 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  30.82 
 
 
470 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 
477 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.05141 
 
 
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NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.68 
 
 
469 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  32.7 
 
 
477 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.95 
 
 
515 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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