More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2260 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  85.95 
 
 		 491 aa  833    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  80.24 
 
 		 495 aa  769    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.71 
 
 		 490 aa  747    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  93.06 
 
 		 490 aa  863    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  87.07 
 
 		 495 aa  840    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  100 
 
 		 504 aa  988    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  78.57 
 
 		 490 aa  770    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  56.38 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.38 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  57.76 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  52.98 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  53.91 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  52.77 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  53.32 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  53.45 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  50.52 
 
 		 529 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.74 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  51.76 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.07 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  52.62 
 
 		 479 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.48 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  51.2 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.43 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  49.46 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  47.68 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.45 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.49 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.88 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  45.73 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.03 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 478 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.7 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  43.91 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  43.7 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 		 465 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  45.03 
 
 		 486 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 		 486 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.81 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  42.95 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.74 
 
 		 476 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 465 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 479 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.21 
 
 		 479 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 473 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.83 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 474 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 474 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.14 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.31 
 
 		 474 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 488 aa  350  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 481 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 		 477 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.82 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  42.55 
 
 		 467 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37 
 
 		 475 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.78 
 
 		 475 aa  316  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  36.78 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.78 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.78 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  36.78 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.78 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.56 
 
 		 467 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 		 475 aa  313  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 475 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  37 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  36.29 
 
 		 475 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  37 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  37 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  37 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 476 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  36.05 
 
 		 484 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  37.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  36.65 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>