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for query gene Franean1_3660 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  74.19 
 
 		 523 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 558 aa  1083    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.37 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.23 
 
 		 519 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.93 
 
 		 559 aa  428  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.51 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.19 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.38 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.55 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.64 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.26 
 
 		 504 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  48.3 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.25 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.09 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.41 
 
 		 534 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.09 
 
 		 491 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.52 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.91 
 
 		 536 aa  327  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.61 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.71 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.77 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  51.95 
 
 		 536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.92 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.14 
 
 		 467 aa  306  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  38.42 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.44 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.74 
 
 		 480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.18 
 
 		 463 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.87 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.27 
 
 		 485 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.36 
 
 		 578 aa  259  8e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.73 
 
 		 485 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  36.79 
 
 		 455 aa  256  7e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.89 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.57 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.57 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.57 
 
 		 475 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.09 
 
 		 484 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.29 
 
 		 534 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  35.14 
 
 		 436 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.76 
 
 		 480 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.87 
 
 		 514 aa  239  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  35.11 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.11 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.88 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.62 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  30.64 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.11 
 
 		 480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 		 514 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  34.61 
 
 		 480 aa  233  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.57 
 
 		 480 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.78 
 
 		 515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.45 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 517 aa  226  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.11 
 
 		 635 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 466 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.98 
 
 		 520 aa  223  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.11 
 
 		 545 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 529 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 507 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.33 
 
 		 507 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.39 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.39 
 
 		 515 aa  217  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.9 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  30.91 
 
 		 496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  32.77 
 
 		 561 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37 
 
 		 558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 		 528 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 597 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.84 
 
 		 658 aa  210  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.94 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 666 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.41 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.73 
 
 		 526 aa  208  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 539 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 525 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.54 
 
 		 599 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 465 aa  207  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  28.54 
 
 		 599 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 570 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.59 
 
 		 526 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  28.34 
 
 		 599 aa  207  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.94 
 
 		 599 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.34 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.74 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 528 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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