More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20770 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
473 aa  892    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.18 
 
 
467 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.92 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.15 
 
 
523 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.26 
 
 
479 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.37 
 
 
509 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.32 
 
 
519 aa  315  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.59 
 
 
541 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 
559 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.56 
 
 
510 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.86 
 
 
485 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.79 
 
 
483 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.39 
 
 
517 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.73 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.06 
 
 
501 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  40.4 
 
 
445 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.8 
 
 
491 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.74 
 
 
504 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.04 
 
 
531 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.64 
 
 
467 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.26 
 
 
534 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.02 
 
 
536 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.64 
 
 
463 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.64 
 
 
484 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.88 
 
 
473 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
485 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 
485 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
536 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.57 
 
 
480 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 
475 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 
475 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  36.96 
 
 
540 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 
475 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.99 
 
 
484 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 
460 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 
493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.91 
 
 
461 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  31.67 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
514 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  28.99 
 
 
436 aa  207  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 
514 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 
545 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
495 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 
480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 
475 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.4 
 
 
503 aa  192  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.8 
 
 
578 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
510 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.92 
 
 
540 aa  190  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  29.24 
 
 
475 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  29.24 
 
 
475 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 
475 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  29.24 
 
 
475 aa  190  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.24 
 
 
475 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.02 
 
 
475 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  29.02 
 
 
475 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
534 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  28.84 
 
 
493 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  29.55 
 
 
467 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 
475 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  29.27 
 
 
465 aa  186  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.41 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  29.41 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 
466 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.15 
 
 
471 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 
579 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  31.28 
 
 
561 aa  183  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
475 aa  183  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 
480 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 
517 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.24 
 
 
478 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.05 
 
 
494 aa  182  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.45 
 
 
467 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.37 
 
 
480 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
558 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  28.95 
 
 
475 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  28.95 
 
 
475 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  28.95 
 
 
475 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  28.95 
 
 
475 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  28.95 
 
 
475 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 
536 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.36 
 
 
480 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.81 
 
 
476 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 
529 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
529 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 
489 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
478 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.46 
 
 
509 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 
549 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 
529 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 
490 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
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