More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2718 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 467 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.18 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.03 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.71 
 
 		 558 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.79 
 
 		 523 aa  310  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.86 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.13 
 
 		 559 aa  298  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 541 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.6 
 
 		 510 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.69 
 
 		 483 aa  269  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  42.4 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 501 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.91 
 
 		 517 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.79 
 
 		 536 aa  266  8e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.58 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.59 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.57 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.63 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  40.05 
 
 		 540 aa  237  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.83 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.85 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 493 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 534 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.2 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.82 
 
 		 467 aa  231  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.36 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.56 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.74 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.44 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  31.25 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.6 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 		 517 aa  202  9e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.67 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  30.16 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 484 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.6 
 
 		 536 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.04 
 
 		 493 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.45 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  28.92 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.19 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.55 
 
 		 578 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 		 529 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 		 529 aa  192  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 529 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  31.73 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.73 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.36 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.75 
 
 		 476 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 646 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.4 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.51 
 
 		 510 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.51 
 
 		 503 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.7 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  31.51 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.68 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 530 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  29.96 
 
 		 477 aa  183  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  31.75 
 
 		 561 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.76 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 		 509 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  30.34 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 511 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 465 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 476 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.27 
 
 		 511 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 471 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.98 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.82 
 
 		 627 aa  178  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 		 609 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.73 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 528 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.73 
 
 		 524 aa  176  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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