More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1686 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
455 aa  890    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.71 
 
 
479 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.82 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  42.89 
 
 
493 aa  351  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.71 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  39.65 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.33 
 
 
559 aa  283  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.75 
 
 
483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
558 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 
491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.1 
 
 
501 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.92 
 
 
523 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.4 
 
 
519 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.25 
 
 
509 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 
510 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 
541 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.22 
 
 
467 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 
504 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.33 
 
 
445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  29.52 
 
 
540 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 
467 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
534 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 
485 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
531 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
517 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.43 
 
 
473 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.05 
 
 
534 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 
463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
536 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.34 
 
 
536 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.47 
 
 
480 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 
493 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 
517 aa  187  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
485 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.67 
 
 
492 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
475 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.67 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.22 
 
 
513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.86 
 
 
461 aa  180  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 
545 aa  180  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  30.33 
 
 
465 aa  180  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.34 
 
 
521 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 
492 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 
484 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.73 
 
 
501 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  30.17 
 
 
492 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  30.17 
 
 
492 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.93 
 
 
492 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 
492 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
537 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 
517 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 
493 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 
510 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 
479 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.36 
 
 
503 aa  176  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 
578 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 
479 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
570 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.13 
 
 
515 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 
514 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 
521 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.47 
 
 
520 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 
526 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
515 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
527 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 
512 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
579 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
519 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.57 
 
 
558 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 
524 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 
527 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  28.03 
 
 
496 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 
514 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 
635 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
519 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.61 
 
 
515 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 
480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 
519 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  28.27 
 
 
465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.71 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  29.34 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0734  lincomycin resistance protein  27.36 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.498733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.45 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.37 
 
 
480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>