More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4406 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.23 
 
 
515 aa  924    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
514 aa  1013    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.24 
 
 
480 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.36 
 
 
480 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.82 
 
 
476 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.82 
 
 
476 aa  329  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
480 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.47 
 
 
558 aa  327  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
480 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  38.43 
 
 
480 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.43 
 
 
480 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  38.43 
 
 
480 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  39.95 
 
 
480 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.69 
 
 
466 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
475 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 
579 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.3 
 
 
523 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 
545 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
501 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.17 
 
 
524 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 
514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.03 
 
 
534 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.09 
 
 
558 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.66 
 
 
541 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
510 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.18 
 
 
501 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 
504 aa  223  4e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.86 
 
 
475 aa  223  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  31.78 
 
 
475 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  31.78 
 
 
475 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  31.78 
 
 
475 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  31.78 
 
 
475 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  31.78 
 
 
475 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  35.17 
 
 
491 aa  219  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 
489 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.89 
 
 
549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.15 
 
 
478 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 
494 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  30.71 
 
 
475 aa  217  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 
528 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
478 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.94 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 
515 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  30.51 
 
 
475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.19 
 
 
489 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
520 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  30.51 
 
 
475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  30.51 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.51 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.51 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  31.49 
 
 
482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.99 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  30.51 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.14 
 
 
517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  30.51 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  30.99 
 
 
467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1410  hypothetical protein  31.71 
 
 
461 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.21 
 
 
515 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  31.14 
 
 
471 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 
478 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1590  hypothetical protein  31.7 
 
 
461 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 
490 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 
470 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 
490 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 
530 aa  210  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 
534 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.11 
 
 
508 aa  210  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.96 
 
 
495 aa  210  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.3 
 
 
469 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.61 
 
 
473 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.35 
 
 
490 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 
505 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 
490 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  31.76 
 
 
464 aa  209  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 
537 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2021  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.45 
 
 
466 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 
489 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  29.92 
 
 
484 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.62 
 
 
763 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  31.34 
 
 
459 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
485 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.47 
 
 
498 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.89 
 
 
478 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 
635 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 
487 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3715  major facilitator transporter  33.26 
 
 
459 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.12 
 
 
480 aa  207  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 
469 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  33.33 
 
 
504 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30 
 
 
561 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.88 
 
 
531 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  33.33 
 
 
474 aa  206  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 
502 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  33.1 
 
 
495 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0479086 
 
 
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NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 
509 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.82 
 
 
488 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
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NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  31.58 
 
 
479 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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