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for query gene Bxe_A1710 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  100 
 
 
480 aa  942    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.18 
 
 
485 aa  601  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  68.75 
 
 
485 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.74 
 
 
484 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.31 
 
 
475 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.31 
 
 
475 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.31 
 
 
475 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.6 
 
 
484 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  63.94 
 
 
461 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2404  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  61.05 
 
 
465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.33 
 
 
523 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 
479 aa  298  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.95 
 
 
558 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.07 
 
 
541 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 
501 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.17 
 
 
510 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.82 
 
 
559 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.34 
 
 
488 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 
509 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 
483 aa  249  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 
504 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.58 
 
 
485 aa  246  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.05 
 
 
536 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 
473 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.3 
 
 
467 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.59 
 
 
519 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.68 
 
 
473 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.79 
 
 
517 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 
467 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 
531 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 
534 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  33.41 
 
 
540 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 
491 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 
493 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 
463 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  31.62 
 
 
455 aa  201  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  30.37 
 
 
493 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.7 
 
 
536 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  29.51 
 
 
436 aa  193  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.45 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 
480 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  31.19 
 
 
480 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
480 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.73 
 
 
480 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  30.73 
 
 
480 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.44 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 
515 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 
520 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 
534 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 
480 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.03 
 
 
476 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.34 
 
 
476 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 
529 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 
514 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
537 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 
521 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.62 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1087  major facilitator transporter  32.72 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.130537  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 
558 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 
579 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 
529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 
529 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
476 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
477 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.41 
 
 
515 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.61 
 
 
503 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 
532 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  33.92 
 
 
466 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 
510 aa  160  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  33.74 
 
 
466 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.81 
 
 
506 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 
460 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  32.66 
 
 
467 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  30.06 
 
 
526 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.43 
 
 
517 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 
515 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  30.06 
 
 
526 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  29.31 
 
 
512 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  29.31 
 
 
512 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 
578 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  29.31 
 
 
512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.35 
 
 
517 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 
485 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.13 
 
 
514 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.853367 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  32.57 
 
 
470 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  29.06 
 
 
512 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  29.02 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 
490 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 
490 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
561 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
520 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
520 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.39 
 
 
527 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 
520 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  29.95 
 
 
511 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  32.29 
 
 
470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
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