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for query gene VC0395_A1022 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  100 
 
 		 511 aa  1033    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  56.63 
 
 		 512 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3117  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.19 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.4 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.92 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.18 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.81 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  43.73 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.99 
 
 		 524 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.87 
 
 		 522 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.18 
 
 		 520 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.36 
 
 		 522 aa  425  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.4 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.57 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.29 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.57 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.38 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.62 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.62 
 
 		 520 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 		 520 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.59 
 
 		 520 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.48 
 
 		 519 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 		 520 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.26 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.24 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.28 
 
 		 519 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.65 
 
 		 527 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.93 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.31 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.06 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.04 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.11 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.25 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.66 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.66 
 
 		 519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.29 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.17 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.45 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.25 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  42.25 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.94 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  42.25 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.87 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.65 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  42.13 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.63 
 
 		 521 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  42.13 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  42.13 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  42.13 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.6 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  41.85 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 527 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 527 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.85 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  41.85 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.52 
 
 		 577 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.76 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.76 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  42.57 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  41.55 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.5 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.5 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.09 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.65 
 
 		 517 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.12 
 
 		 511 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.91 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.47 
 
 		 529 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.68 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.08 
 
 		 520 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.48 
 
 		 511 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.66 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  41.93 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.65 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
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NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.16 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
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