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for query gene Gbro_0842 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 493 aa  968    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.49 
 
 		 541 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.19 
 
 		 536 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  62 
 
 		 504 aa  513  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.96 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.2 
 
 		 531 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.14 
 
 		 534 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  47.89 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.97 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.68 
 
 		 523 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.71 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.47 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.84 
 
 		 479 aa  329  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.46 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.2 
 
 		 488 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.3 
 
 		 485 aa  294  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.81 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.99 
 
 		 578 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 491 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.64 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.92 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.02 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 579 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  36.1 
 
 		 480 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.44 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
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NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.62 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.6 
 
 		 558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.27 
 
 		 545 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.25 
 
 		 534 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.61 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 493 aa  232  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.6 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.38 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.64 
 
 		 485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 485 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  29.61 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  31.95 
 
 		 561 aa  216  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 511 aa  216  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  32.38 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  28.98 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  29.21 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.56 
 
 		 514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.21 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 		 480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 529 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  29.69 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 570 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.41 
 
 		 461 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 		 521 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.9 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 510 aa  210  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  31.47 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.03 
 
 		 503 aa  209  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 635 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 484 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.93 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.13 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.84 
 
 		 658 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 524 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 		 564 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.7 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 537 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  31.58 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 579 aa  206  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  31.51 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 475 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 526 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 475 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.12 
 
 		 475 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  31.58 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  31.58 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  31.58 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 506 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.18 
 
 		 599 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  31.58 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.18 
 
 		 599 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.46 
 
 		 520 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.9 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  31.93 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.93 
 
 		 599 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.46 
 
 		 520 aa  203  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.68 
 
 		 599 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  30.58 
 
 		 511 aa  202  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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