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for query gene RSc1852 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  100 
 
 		 512 aa  1014    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1022  multidrug resistance protein VceB  56.63 
 
 		 511 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.5 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3117  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.49 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.71 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  45.19 
 
 		 518 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.73 
 
 		 520 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.58 
 
 		 518 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.56 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.29 
 
 		 520 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.73 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.92 
 
 		 520 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.92 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.27 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.03 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.27 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.27 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.73 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.73 
 
 		 520 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 519 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.27 
 
 		 519 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.27 
 
 		 519 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.64 
 
 		 537 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.38 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.73 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.73 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.26 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.13 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.56 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.58 
 
 		 522 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.26 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.2 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.6 
 
 		 519 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.07 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.4 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.2 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.23 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.08 
 
 		 527 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.38 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.38 
 
 		 533 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.68 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.35 
 
 		 520 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.89 
 
 		 518 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  43.58 
 
 		 525 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  43.98 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.47 
 
 		 577 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 522 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.33 
 
 		 531 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.38 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  44.4 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.52 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  45.31 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 527 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.91 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  44 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  44 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.99 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 		 521 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.14 
 
 		 520 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  44.2 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  45.31 
 
 		 528 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.28 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.33 
 
 		 515 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  44.89 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  45.49 
 
 		 509 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.01 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.79 
 
 		 522 aa  392  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  42.35 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.19 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1077  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.31 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476678  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1879  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.31 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000219002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.96 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  42.35 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.75 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.35 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4010  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.01 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.91 
 
 		 511 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  44.2 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
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NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.94 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
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