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for query gene PA14_68140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.98 
 
 
511 aa  807    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.79 
 
 
511 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  76.11 
 
 
512 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  75.76 
 
 
512 aa  784    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.8 
 
 
509 aa  826    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.36 
 
 
511 aa  818    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  98.82 
 
 
509 aa  1003    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  76.38 
 
 
511 aa  811    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  65.86 
 
 
529 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2467  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.05 
 
 
508 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  100 
 
 
509 aa  1011    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01157  multidrug resistance membrane translocase  63.52 
 
 
501 aa  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.67 
 
 
505 aa  600  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.78 
 
 
512 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.99 
 
 
512 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.22 
 
 
511 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  52.36 
 
 
511 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.36 
 
 
511 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  52.36 
 
 
511 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
520 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
520 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
520 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
520 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
520 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.7 
 
 
520 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.8 
 
 
520 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 
510 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.41 
 
 
520 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.13 
 
 
511 aa  501  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.31 
 
 
511 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.34 
 
 
520 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  50.2 
 
 
512 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.34 
 
 
520 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  50 
 
 
512 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.74 
 
 
520 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.14 
 
 
520 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50 
 
 
521 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  50 
 
 
512 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  50.2 
 
 
512 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.51 
 
 
515 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.84 
 
 
544 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
520 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.14 
 
 
520 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
527 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.95 
 
 
520 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.7 
 
 
519 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
512 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.5 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.5 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.5 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
512 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.2 
 
 
513 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.13 
 
 
520 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7509  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.2 
 
 
517 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 
519 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.33 
 
 
520 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  49.8 
 
 
515 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 
519 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 
519 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  49.59 
 
 
518 aa  480  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2415  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.78 
 
 
517 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.49 
 
 
521 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.55 
 
 
522 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.11 
 
 
515 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.32 
 
 
517 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.6 
 
 
533 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.59 
 
 
537 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.11 
 
 
519 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2022  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.18 
 
 
520 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.18 
 
 
518 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.98 
 
 
518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.2 
 
 
524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.57 
 
 
525 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5791  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.12 
 
 
517 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0859755  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6206  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.39 
 
 
520 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.37 
 
 
543 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.77 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  49.68 
 
 
531 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4313  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  48.1 
 
 
519 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.58 
 
 
577 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440847  normal  0.0484708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.03 
 
 
494 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0256  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.83 
 
 
522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.76 
 
 
520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
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NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.31 
 
 
522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.516199 
 
 
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NC_008782  Ajs_0261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.62 
 
 
522 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135195 
 
 
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