More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3619 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 536 aa  1063    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  57.59 
 
 		 541 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.39 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  59.19 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.71 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.81 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.65 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  45.74 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.02 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.91 
 
 		 558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 		 523 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.05 
 
 		 501 aa  309  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.91 
 
 		 479 aa  297  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.26 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.91 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.94 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.13 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  39.53 
 
 		 536 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.66 
 
 		 483 aa  261  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.9 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.58 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 473 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 		 473 aa  247  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
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NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.16 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.64 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.46 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  38.29 
 
 		 445 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  31.2 
 
 		 493 aa  226  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 558 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  33.5 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.09 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.18 
 
 		 597 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 480 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 532 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.44 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  30.44 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  31.9 
 
 		 599 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.44 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.44 
 
 		 480 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.93 
 
 		 599 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  31.51 
 
 		 599 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.1 
 
 		 536 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.51 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.72 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 530 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.44 
 
 		 480 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.56 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  30.21 
 
 		 480 aa  212  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.89 
 
 		 515 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 579 aa  210  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.7 
 
 		 480 aa  210  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.26 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  30.06 
 
 		 561 aa  209  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.83 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.4 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.68 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.61 
 
 		 476 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.59 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.52 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.11 
 
 		 512 aa  207  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 524 aa  206  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 485 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.74 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 537 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 635 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 485 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 527 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
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NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.22 
 
 		 529 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 523 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1852  multidrug resistance transmembrane protein  32.65 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119423 
 
 
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NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.89 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
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NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.82 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.24 
 
 		 525 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
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NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 516 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 529 aa  199  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
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NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 490 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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