More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3652 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 489 aa  976    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  50.43 
 
 		 490 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.45 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 478 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.18 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 486 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  48.07 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.06 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.93 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 474 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  46.54 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  48.81 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.86 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.97 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 474 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.97 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 481 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 490 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.13 
 
 		 490 aa  352  7e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  40.17 
 
 		 495 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  41.27 
 
 		 462 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 482 aa  349  6e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 491 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  40.47 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 467 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 493 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 471 aa  326  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.06 
 
 		 471 aa  326  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.48 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 481 aa  323  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.25 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.83 
 
 		 474 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.91 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 499 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 493 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 498 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.72 
 
 		 467 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 467 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 472 aa  297  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.31 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  40 
 
 		 474 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 488 aa  286  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 471 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 471 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 471 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 462 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  37.42 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.55 
 
 		 485 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 495 aa  272  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  36.43 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 486 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 475 aa  270  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.95 
 
 		 473 aa  269  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.34 
 
 		 465 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 489 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3603  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0932  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.09 
 
 		 468 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.997162  normal  0.891592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.67 
 
 		 471 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  35.65 
 
 		 475 aa  266  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  34.81 
 
 		 475 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  35.42 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  34.81 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  34.81 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  34.81 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.42 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  35.42 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  38.05 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>