More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2750 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2750  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 501 aa  983    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.4 
 
 		 475 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 		 558 aa  286  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  32.97 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.97 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  34.43 
 
 		 480 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 480 aa  273  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 466 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.62 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.77 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.62 
 
 		 476 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 509 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 558 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 541 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 		 534 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 504 aa  179  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.07 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  28.51 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  28.51 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  28.51 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.2 
 
 		 488 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.51 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.51 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.28 
 
 		 475 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 537 aa  176  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 537 aa  176  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  28.28 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  28.28 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.03 
 
 		 579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 514 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.59 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.39 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.72 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 526 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 529 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.75 
 
 		 530 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 493 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  26.64 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  26.64 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  26.64 
 
 		 475 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 481 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  26.64 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  29.89 
 
 		 474 aa  169  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  26.64 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 		 529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 528 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 		 515 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0730599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  32.05 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.1 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.94 
 
 		 467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.29 
 
 		 532 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.04 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 		 470 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.7 
 
 		 469 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.15 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
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NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.97 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  28.7 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
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NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 464 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4472  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 519 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238318  normal  0.949404 
 
 
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NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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