More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0673 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  77.14 
 
 		 493 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  100 
 
 		 481 aa  933    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 490 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.12 
 
 		 487 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.49 
 
 		 480 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 473 aa  350  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  43.39 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  50.55 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  45.28 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3603  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 464 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534185  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  39.65 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.42 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.25 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.83 
 
 		 476 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.11 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 479 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  39.17 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.56 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.27 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  38.05 
 
 		 495 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  40.3 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.65 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.45 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.09 
 
 		 471 aa  276  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 474 aa  276  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  36.11 
 
 		 458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  35.74 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 479 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  37.42 
 
 		 475 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  37.42 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.42 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.42 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.42 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  37.42 
 
 		 475 aa  273  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  35.4 
 
 		 471 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.2 
 
 		 475 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 467 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  36.6 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  37.2 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  37.2 
 
 		 467 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.48 
 
 		 467 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.12 
 
 		 471 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.47 
 
 		 475 aa  269  8.999999999999999e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  36.85 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 462 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  36.48 
 
 		 475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  36.48 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  36.48 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  36.48 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 498 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 458 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  36.48 
 
 		 475 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.19 
 
 		 477 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 462 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.6 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  37.19 
 
 		 477 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.53 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 493 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.64 
 
 		 478 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  37.64 
 
 		 478 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0480  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 488 aa  263  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  38.88 
 
 		 493 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.58 
 
 		 480 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0730599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  37.63 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 465 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>