More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0724 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  74.89 
 
 
493 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  91.51 
 
 
471 aa  818    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  71.7 
 
 
499 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
471 aa  907    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  74.47 
 
 
493 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  74.04 
 
 
493 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.01 
 
 
490 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  58.01 
 
 
490 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.71 
 
 
490 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  57.11 
 
 
495 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  56.93 
 
 
504 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  55.63 
 
 
491 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  56.69 
 
 
495 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  55.26 
 
 
467 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.92 
 
 
470 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  59.28 
 
 
479 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.92 
 
 
474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  55.92 
 
 
467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.22 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  52.4 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  56.29 
 
 
469 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  56.24 
 
 
464 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  55.26 
 
 
474 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  51.63 
 
 
467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  53.86 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  54.05 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  56.95 
 
 
472 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.88 
 
 
465 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  49.24 
 
 
498 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  51.6 
 
 
491 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  50.55 
 
 
465 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  49.89 
 
 
474 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  49.67 
 
 
471 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  49.67 
 
 
471 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  49.24 
 
 
471 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  49.46 
 
 
462 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  50.43 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  50.43 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  48.59 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  48.37 
 
 
462 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.87 
 
 
465 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 
486 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.22 
 
 
465 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.41 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 
478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.4 
 
 
480 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  46.71 
 
 
484 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  47.25 
 
 
462 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
480 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 
476 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  45.05 
 
 
474 aa  359  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  44.83 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  43.1 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 
479 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  44.03 
 
 
474 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  44.03 
 
 
474 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.25 
 
 
474 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  45.61 
 
 
474 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.18 
 
 
474 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  44.74 
 
 
473 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  43.82 
 
 
474 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.79 
 
 
495 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
481 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
477 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 
489 aa  329  5.0000000000000004e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  43.27 
 
 
465 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 
481 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  45.02 
 
 
486 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 
481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  42.98 
 
 
488 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.56 
 
 
475 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  47.51 
 
 
467 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  39.78 
 
 
475 aa  312  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  39.34 
 
 
475 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 
471 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  39.34 
 
 
475 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  39.34 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  39.34 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.34 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  39.34 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  39.34 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  39.78 
 
 
475 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  39.78 
 
 
475 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  39.78 
 
 
475 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  39.78 
 
 
475 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  39.12 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.12 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  40.44 
 
 
474 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.71 
 
 
475 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237506  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
467 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  41.96 
 
 
462 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1135  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0750633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1979  major facilitator family transporter  49.02 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1575  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.660118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.02 
 
 
467 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.519211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>