More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5588 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  100 
 
 		 525 aa  1059    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.22 
 
 		 536 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  64.8 
 
 		 531 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  61.32 
 
 		 554 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 		 526 aa  391  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  41.32 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.94 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.02 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.82 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.82 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.02 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.66 
 
 		 530 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.02 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 		 534 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  40.82 
 
 		 539 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.31 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  41.02 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.25 
 
 		 516 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.75 
 
 		 537 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.87 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.69 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.28 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.88 
 
 		 530 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.4 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.63 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.35 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.21 
 
 		 525 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.42 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 532 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 506 aa  346  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.33 
 
 		 526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.76 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 511 aa  332  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  36.71 
 
 		 511 aa  329  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  36.71 
 
 		 511 aa  329  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.71 
 
 		 511 aa  329  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2808  multidrug resistance protein B  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.001171  hitchhiker  0.00961991 
 
 
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CP001509  ECD_02541  multidrug efflux system protein  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.812517  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0998  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.614852  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_1021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0123748 
 
 
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NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.14 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3931  multidrug resistance protein B  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168353  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02506  hypothetical protein  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.781266  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2969  multidrug resistance protein B  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2822  multidrug resistance protein B  36.93 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.292864  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_0857  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.46 
 
 		 510 aa  326  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  35.42 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.32 
 
 		 511 aa  324  3e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  35.34 
 
 		 512 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.31 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  35.14 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  35.14 
 
 		 512 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 527 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.58 
 
 		 527 aa  320  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3190  multidrug resistance protein B  36.7 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 526 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.53 
 
 		 512 aa  316  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3121  multidrug resistance protein B  35.14 
 
 		 512 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0252817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.65 
 
 		 509 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0889  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 513 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.57 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 544 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.51 
 
 		 537 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0715517  normal  0.28108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  34.48 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.09 
 
 		 524 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.29 
 
 		 520 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1122  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 518 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  0.386447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 518 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0951018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 513 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.74 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  36.33 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 529 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.39 
 
 		 529 aa  300  5e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 520 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 529 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.33 
 
 		 520 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 		 529 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  36.12 
 
 		 509 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.13 
 
 		 520 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.33 
 
 		 511 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 		 511 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.04 
 
 		 516 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 529 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.73 
 
 		 507 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
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NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  34.04 
 
 		 514 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.11 
 
 		 515 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 520 aa  296  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  35.52 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
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