More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2425 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  94.8 
 
 		 481 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 481 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1639  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.06 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3056  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.150978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2292  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7172  major facilitator superfamily MFS_1  46.92 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6850  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.48 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.473819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2689  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3652  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3085  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3430  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74663  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3074  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4654  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.87 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00157421  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5293  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.141336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.35 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.2 
 
 		 470 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0355  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 474 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.55 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0587  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 491 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2482  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5182  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 481 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0430  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.54 
 
 		 474 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03361  MFS permease  42.17 
 
 		 462 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3608  putative multidrug efflux protein  43.2 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0475  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 474 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2148  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.68 
 
 		 490 aa  352  8e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3195  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1202  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.12 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3075  major facilitator transporter  42.4 
 
 		 495 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0479086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5406  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.395766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39950  MFS transporter  45.2 
 
 		 467 aa  342  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0366736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2999  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0222904  decreased coverage  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0724  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.56 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0914  MFS permease  41.33 
 
 		 473 aa  336  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2214  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1111  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1329  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 472 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3813  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4675  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.235622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4300  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 467 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.838701  normal  0.409906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0628  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  42.01 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0297622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3738  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 493 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.73055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0687  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.52 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0497026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0820  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2031  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  40.91 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232006  normal  0.319665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.28 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3429  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4121  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0673  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 481 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3624  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.617824  normal  0.0410377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2236  major facilitator superfamily MFS_1  40.04 
 
 		 465 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 484 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3870  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3733  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 474 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231199  normal  0.165814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0469  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.235487  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4238  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.747495  normal  0.251377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 471 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4761  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.953291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  38.73 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  39.08 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  39.08 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  39.08 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  35.91 
 
 		 480 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  39.82 
 
 		 462 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  39.08 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3499  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.198805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4867  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0082  major facilitator transporter  39.96 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.800514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0838  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1753  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.13 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1804  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.77 
 
 		 475 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.48 
 
 		 465 aa  293  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0992  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 486 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0904  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 465 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.674587  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1168  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.27 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.579921  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1545  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.27 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0073  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.27 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2018  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.858513  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.76 
 
 		 475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.05 
 
 		 477 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  36.54 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.54 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.54 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  36.54 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.54 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.54 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3327  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.32 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  38.83 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.8 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  36.32 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3603  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 		 464 aa  280  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>