More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0354 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  100 
 
 		 484 aa  935    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.42 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.54 
 
 		 501 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.23 
 
 		 495 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 462 aa  246  6.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 478 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.75 
 
 		 474 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.88 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.38 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.19 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  33.1 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 		 493 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 		 522 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 		 475 aa  192  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.71 
 
 		 480 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 478 aa  190  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34 
 
 		 514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 486 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.67 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
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NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  31.37 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.62 
 
 		 484 aa  180  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 515 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.14 
 
 		 579 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  27.86 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
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NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.46 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 476 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 505 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  30.5 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  30.5 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  30.17 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.06 
 
 		 509 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.78 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
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NC_009436  Ent638_3164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.67 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.18 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.26 
 
 		 685 aa  173  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2932  multidrug resistance protein B  30.21 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 		 511 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 523 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 485 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.04 
 
 		 541 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 482 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2963  multidrug resistance protein B  30.21 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3015  multidrug resistance protein B  30.21 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551844  hitchhiker  0.000631147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2998  multidrug resistance protein B  30.21 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000766816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.5 
 
 		 507 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 477 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.56 
 
 		 471 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.54 
 
 		 522 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 635 aa  172  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
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NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.87 
 
 		 569 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.171868 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 		 540 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  30.58 
 
 		 465 aa  170  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 		 509 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.83 
 
 		 504 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  30.09 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
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NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  31.31 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  29.86 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  33.17 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.42 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
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