More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0858 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  919    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  55.05 
 
 		 478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2030  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.275978  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.07 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 496 aa  243  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 		 501 aa  226  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 		 475 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1287  hypothetical protein  35.97 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.188212 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 462 aa  209  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.88 
 
 		 480 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.81 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  31.13 
 
 		 484 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.3 
 
 		 500 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1959  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.979319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.15 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.98 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 475 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  31.03 
 
 		 462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.95 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  30.73 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  29.92 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 465 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.86 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  28.74 
 
 		 477 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  28.5 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.2 
 
 		 522 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.53 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 		 534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  29.24 
 
 		 466 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  28.78 
 
 		 508 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  33.44 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  33.44 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.68 
 
 		 477 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  33.44 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  32.68 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 579 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 463 aa  151  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.71 
 
 		 540 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  28.3 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  26.85 
 
 		 484 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 627 aa  150  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.73 
 
 		 482 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  30.69 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 515 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  31.65 
 
 		 498 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 609 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 503 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.6 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 		 482 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 478 aa  148  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  27.76 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.42 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  30.35 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 541 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  27.54 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>